Sektor za koordinaciju procesa pridruživanje vrši poslove koji se odnose na upravljanje procesom pridruživanja i pristupanja Crne Gore Evropskoj uniji, u dijelu praćenja sprovođenja Sporazuma o stabilizaciji i pridruživanju i Privremenog sporazuma o trgovini i srodnim pitanjima između Evropskih zajednica i njenih država članica, sa jedne strane, i Crne Gore, sa druge strane, kao i  koordinaciju i praćenje rada zajedničkih tijela, osnovanih Sporazumom; međuresorske pripreme i koordinacije procesa pregovora sa Evropskom unijom; pripreme i redovne revizije strateških dokumenata vezanih za proces evropskih integracija; saradnju državnih organa sa institucijama, organima i tijelima Evropske unije, njenim državama članicama, državama kandidatima i potencijalnim kandidatima u procesu pridruživanja i pristupanja Evropskoj uniji; poslove koordinacije usklađivanja propisa s propisima Evropske unije, kao i potvrđivanja obrasca i tabele o usklađenosti propisa sa propisima Evropske unije; kao i druge poslove iz djelokruga Ministarstva.

a) U Odsjeku za koordinaciju, analitiku i izvještavanje  obavljaju se poslovi koji se odnose na upravljanje procesom pridruživanja i pristupanja Crne Gore Evropskoj uniji u dijelu koordinacije, analitike i izvještavanja o procesu pridruživanja i pristupanja Evropskoj uniji; koordinacije i praćenja rada zajedničkih tijela, osnovanih Sporazumom o stablizaciji i pridruživanju; međuresorske pripreme i koordinaciju procesa pregovora sa Evropskom unijom; pripreme i redovne revizije Nacionalnog programa za integraciju Crne Gore u EU i ostalih strateških dokumenata vezanih za proces evropskih integracija; saradnju državnih organa sa institucijama, organima i tijelima Evropske unije, njenim državama članicama, državama kandidatima i potencijalnim kandidatima u procesu pridruživanja i pristupanja Evropskoj uniji.

b) U Odsjeku za harmonizaciju zakonodavstva  obavljaju se poslovi koji se odnose na koordinaciju usklađivanja zakonodavstva Crne Gore s propisima Evropske unije (Acquis Communitaire) i razvoj tzv. Nacionalnog Acquis-a kroz koordinaciju pripreme, praćenje izrade i sprovodjenje Nacionalnog programa za postepeno preuzimanje i integrisanje evropskih propisa u nacionalni pravni sistem; potvrđivanje obrasca i tabele o usklađenosti propisa sa propisima Evropske unije; saradnju sa specijalizovanim institucijama; i druge aktivnosti u funkciji usvajanja standarda i propisa Evropske unije.

(Član 3. Pravilnika o unutrašnjoj organizaciji i sistematizaciji Ministarstva za evropske integracije, Podgorica, 9. jul 2009. god.)